Honey Don't utspelar sig i Bakersfield, Kalifornien, och följer Honey O'Donahue (Margaret Qualley), en privatdetektiv som dras in i en farlig härva efter att en potentiell klient dör i en mystisk bilolycka. Spåren leder henne till en suspekt megakyrka, Four-Way Temple, som styrs av den karismatiske men djupt korrupte Reverend Drew Devlin (Chris Evans). Samtidigt som Honey försöker lösa mordgåtan och nysta upp pastorns kopplingar till droghandel, inleder hon en affär med den tuffa polisen MG Falcone (Aubrey Plaza) och försöker skydda sin tonåriga systerdotter Corinne från farliga kretsar.