"Flykten över sundet" utspelar sig 1943. En judisk jazzmusiker bor i Köpenhamn med sin fru och deras 6-åriga son, men när tyskarna börjar deportera judar, flyr familjen från sitt hem.Målet är att sätta sig i säkerhet i Sverige, och vägen dit går via den lilla kustbyn Gilleleje, där lokala fiskare seglar flyktingar över sundet. Men Gestapo arbetar med danska kollaboratörer, och familjens överlevnad är beroende av sina medmänniskos tillit och hjälp.