Shrek och Fiona har precis återvänt till sitt hemtrevliga träsk när de blir bjudna till Fionas föräldrar, kungen och drottningen av Landet-i-fjärran. Med en djup suck lämnar de gyttjeduschen bakom sig, packar ner matsäckslarverna och ger sig i väg. Framme i Landet-i-fjärran kantas gatorna av nyfikna undersåtar som alla hoppas på att få en glimt av Fionas prins. Chocken blir dock stor när den efterlängtade prinsen visar sig vara ett träsktroll och kungens och drottningens reaktion på Fionas "förändring" låter inte vänta på sig. Äktenskapet mellan Fiona och Shrek stämmer definitivt inte med kungens idé om ett lyckligt slut och han bestämmer sig för att göra sig av med sin svärson för gott. Till sin hjälp tar han tre av sagovärldens riktiga kändisar; Den Goda Feen, som får i uppdrag att förvandla Fiona till sitt forna jag, Prince Charming vars uppgift blir att förvrida huvudet på prinsessan och den sluge Mäster-Katten-i-Stövlarna för att föra Shrek bakom ljuset. Som tur är har Shrek och Fiona ett äss i ärmen - den korkade, men ack så lojale, Åsnan